จอมโจรคิด เป็นเรื่องราวของคุโรบะ ไคโตะ ตัวละครเอกของเรื่อง ไคโตะเป็นเด็กนักเรียนชั้นมัธยมปลายที่มีฝีมือในการเล่นมายากล ซึ่งได้รับการฝึกสอนจากคุโรบะ โทอิจิ ผู้เป็นพ่อ ไคโตะมีเพื่อนสนิทในวัยเด็กคือ นาคาโมริ อาโอโกะ ต่อมาพ่อของไคโตะ ถูกฆ่าตาย วันหนึ่งไคโตะได้ไปค้นพบห้องลับของพ่อ โดยตอนนั้นเขาไปจับรูปของพ่อแล้วรูปก็พลิกกลับหลัง ทำให้เขาได้พบห้องลับ และเมื่อเข้าไปก็เจอหมวกทรงสูงสีขาว สูทขาว ผ้าคลุม แว่นตาขาเดียว จึงรู้ว่าพ่อของตนเป็นจอมโจรคิด และเมื่อรู้ว่าพ่อถูกฆ่าตาย ไคโตะจึงกลายเป็นจอมโจรคิด เพื่อออกติดตามค้นหาศัตรูที่ฆ่าพ่อของตนเอง (ก่อนที่ไคโตะจะรู้ความจริง จิอิ โคโนะสึเกะได้เป็นจอมโจรคิดชั่วคราว เพื่อตามหาคนที่ฆ่าโทอิจิ) ไคโตะ ถูกนาคาโมริ กินโซ พ่อของอาโอโกะ เป็นคู่ปรับในการออกตามล่าจอมโจรคิด ทำให้เกิดเรื่องราววุ่นวายเสมอ ๆ