หลังสงครามแปซิฟิก องค์กรนินจาล่มสลายเพราะพัวพันกับการก่อการร้าย มีนินจาจำนวนมากนับแสนคน หลบซ่อนตัวอยู่ในสังคม คุโมะงาคุเระ คุโระ หนึ่งในนินจาชั้นกระจอก เขามีวิชาตัวเบาที่พอใช้ได้ แต่ใช้ประโยชน์ไม่ได้ เขาใช้ชีวิตแบบพวกไม่มีงานทำในที่พักซอมซ่อ แต่ก็เกิดเหตุฆาตกรรมจากเหล่านินจา ทำให้เขาเข้ามาพัวพัน