เรื่องย่อหนัง Mobile Suit Gundam Char Counter Attack ศักราชอวกาศที่ 0093 ในช่วงเวลาที่ผู้คนเชื่อว่าสาธารณรัฐซีอ้อนกำลังอ่อนแอ ชาร์ อัสนาเบิ้ล ก็กลับมาปรากฎตัวอีกครั้งในหน้าประวัติศาสตร์ และเปิดเผยว่าคนเองคือ แคสวัล เลม ไดคุน ทายาทที่แท้งริงของซีอ้อน และกลายเป็นผู้นำของกองทัพนีโอซีอ้อนเดินหน้าสู่สนามรบและต่อสู้เพื่ออุดมการณ์ของซีอ้อนอีกครั้ง อีกด้านหนึ่ง อามุโร่ เรย์ ที่คาดว่า ชาร์ ที่เป็นศัตรูคู่ปรับจะต้องกลับมาอีกครั้ง ก็ได้เตรียมรับมือการต่อสู้ครั้งใหม่พร้อมกับหน่วยลอนโด เบลล์ กองกาลังอิสระภายใต้สังกัดกองทัพสหพันธ์โลก แม้ว่าจะไม่ได้รับการสนับสนุนอย่างที่ควร แต่เมื่อมีการยืนยันได้ว่า ชาร์ วางแผนจะทิ้งสถานีอวกาศขนาดใหญ่ลงบนโลก อามุโร่ กับ ไบรท์ โนอา กัปตันเรือที่เคยร่วมต่อสู้ด้วยกันในสงครามครั้งก่อน จึงต้องรีบระดมพลเพื่อหาทางหยุดยั้งแผนร้าย สงครามครั้งใหม่ที่กำลังจะก่อตัวขึ้น จึงไม่ใช่แค่ศึกตัดสินของคู่รักคู่แค้นที่ อย่าง อามุโร่ กับ ชาร์ ที่ปะทะกันมาเป็นสิบปี แต่นี่ยังเป็นสงครามที่จะทำให้เห็นว่าเหล่านิวไทป์จะนำพาอะไรให้กับยุคศักราชอวกาศอีกด้วย
