"รักที่ขอนแก่น" เล่าเรื่องราวที่เกิดขึ้นในจังหวัดขอนแก่น ซึ่งแม่บ้านหญิงวัยกลางคนที่โดดเดี่ยวผู้หนึ่ง ต้องรับหน้าที่พยาบาลทหารหนุ่มผู้ป่วยไข้เป็นเจ้าชายนิทรา และตกเข้าสู่ห้วงหุบของภาพหลอน ซึ่งนำเขาไปสู่ความฝันอันแปลกประหลาด, เหล่าภูตผี และอารมณ์รักโรแมนติกอภิชาติพงศ์ระบุว่า เขาเขียนบทภาพยนตร์เรื่องนี้ ขณะที่ครุ่นคิดตรึกตรองถึงชะตากรรมของประเทศไทย ซึ่งเป็นชาติที่ป่วยไข้ นอกจากนี้ "รักที่ขอนแก่น" ยังเป็นหนังเรื่องแรกของเจ้าของรางวัลปาล์มทองคำชาวไทย ที่มีเรื่องราวทั้งหมดเกิดขึ้นที่จังหวัดขอนแก่น ซึ่งเป็นบ้านเกิดของเขา ยิ่งกว่านั้น มันยังเป็นเหมือนภาพบันทึกส่วนตัว ว่าด้วยสถานที่ที่ฝังตรึงผูกติดอยู่กับชีวิตของอภิชาติพงศ์ ดังราวกับปรสิต อาทิ โรงเรียนประถม, โรงพยาบาล, ห้องสมุด และบึงน้ำอภิชาติพงศ์อธิบายว่า เขาก็คงไม่ต่างกับบรรดาตัวละครผู้หลับใหลในภาพยนตร์เรื่องนี้ ที่พยายามหลบเลี่ยงหลีกหนี "โรคภัยไข้เจ็บแห่งความจริง" เขาและตัวละครเหล่านั้น ต่างพยายามอพยพลี้ภัยไปยังอาณาจักรแห่งความฝัน ตลอดกาล
